Спустя три дня поддержка ответила и проблема решилась (довольно оперативно и не пришлось сейвы удалять :d). Как я и писал ранее проблема оказалась в нестыковке баз данных полсе апдейта, стыковался со станцией, а после апдейта оказался на аутпосте на анаконде и еще название аутпоста поменялось. В итоге мой корабль просто перебросили в другую систему и проблема исчезла, надеюсь автору топика тоже все исправили... Всем удачных полетов и итересных открытий!